Le Musée Antonien est le lieu de la Mémoire : ici sont rassemblés plusieurs objets qui témoignent de l’histoire ancienne de la décoration intérieure de la Basilique ou qui sont liés au culte et à l’iconographie de saint Antoine. L’actuel Musée Antonien a été inauguré en 1995, mais sa fondation remonte à un siècle plus tôt. Bien que petit, il rassemble des objets réalisés à partir du début du XIVe siècle, d’authentiques trésors d’art, réalisés pour la Basilique et le complexe conventuel tout au long de leur histoire séculaire, qui a commencé dans la lointaine année 1232 avec la pose de la première pierre de la construction de la Basilique.