Nos encontramos ahora en la Capilla de la Virgen Mora, la antigua pequeña iglesia de Santa Maria Mater Domini, el primer núcleo donado por el obispo de Padua a los franciscanos. Aquí vivió y rezó Antonio; aquí fue enterrado y permaneció durante 32 años, hasta 1263.
En el altar se encuentra la estatua que da nombre a la capilla: la estatua de la Virgen Mora, de piedra pintada, muy querida por los devotos, realizada en 1396 por Rinaldino de Francia, conocida con este nombre por sus rasgos orientales.